Jonathan Agudelo llegó por pedido de Sebastián Méndez, quien lo había dirigido antes de llegar a Gimnasia. Esa posibilidad le valió una buena consideración para mostrarse en la pretemporada.
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Con el correr de las semanas se ganó un lugar en el equipo titular y convirtió un gol ante Huracán, después de un flojo estreno ante Vélez. Pero la suerte no lo acompañó y a la siguiente fecha se lesionó.
Después de unas semanas al margen, el delantero volvió a entrenar con el plantel y ante Atlético de Tucumán fue considerado nuevamente por Diego Armando Maradona, concentró pero no sumó minutos.
En la previa ante Boca, vuelve a estar en la consideración y fue quien reemplazó a Nicolás Contín por momentos en la práctica de fútbol. El delantero podría sumar minutos en la Bombonera, asomando como el jugador “
